Förbundsstyrelsen (FS) är SISU:s beslutande organ. FS består av elva personer. Ordförande är Björn Eriksson som också är ordförande i SISU Idrottsutbildarna samt Riksidrottsförbundet. Invald till FS blir man vid SISU-stämman som äger rum vartannat år.
SISU Idrottsutbildarnas generalsekreterare Stefan Bergh är föredragande i riksidrottsstyrelsen.